As Comissões Temáticas auxiliam a Diretoria da ANADEP na construção de políticas públicas, nas pautas jurídica e legislativa, confeccionando notas técnicas, públicas e participando de audiências públicas. Até o momento, a ANADEP dispõe de 15 comissões.
Comissão da Infância e Juventude: Janaynna Marrocos Macaúbas Torres e Marcos Lourenço Capanema de Almeida
Comissão da Saúde: João Mateus Silva Fagundes Oliveira e Bruno Barcala Reis
Comissão de Mobilidade Urbana, Moradia e Questões Fundiárias: Carolina Morishita Mota Ferreira e Cleide Aparecida Nepomuceno
Comissão da Diversidade Sexual: João Mateus Silva Fagundes Oliveira e Mônica Alves da Costa
Comissão dos Direitos das Famílias: Flávia Marcelle Torres Ferreira de Morais e Isadora Vieira Amorim Santos
Comissão dos Direitos da Mulher: Welda Rodrigues Souza e Mônica Alves da Costa
Comissão dos Direitos do Consumidor: Gustavo Francisco Dayrell de Magalhães Santos e Paulo César Azevedo de Almeida
Comissão para Assuntos Internacionais: Mariana Carvalho de Paula de Lima e Marina Buck Carvalho Sampaio
Comissão de Política Criminal: Sérgio Augusto Riani do Carmo e Carlos Eduardo Vieira da Silva
Comissão de População em situação de rua: Jaqueson Antônio da Silva e Junia Roman Carvalho
Comissão da Igualdade étnico-racial: Maxnei Gonzaga e Lígia Olimpio de Oliveira
Comissão dos Direitos da Pessoa com deficiência: Luis Renato Braga Arêas Pinheiro e Estevão Machado de Assis Carvalho
Comissão dos Direitos da Pessoa Idosa: Fernanda Cristiane Heringer Milagres e Luis Renato Braga Arêas Pinheiro
Comissão de Justiça Ambiental e Climática: Carolina Morishita Mota Ferreira e Ana Cláudia da Silva Alexandre Storch
Comissão de Defesa dos direitos dos povos indígenas: Carolina Morishita Mota Ferreira e Ana Cláudia da Silva Alexandre Storch
